История НВМБ: с 1925 по 1940 годы база номинально существовала, затем стала подразделением армии. В 1941 году сформировали штат, развернули дивизионы охраны рейда, учебный дивизион, отряд торпедных катеров, береговую артиллерию. Во время войны поддерживала гарнизоны Одессы и Севастополя. В 1942 году штаб переехал в Геленджик; в 1943 году базу освободили, далее уничтожили мин.

В 1947 году базу расформировали, после распада СССР снова стали обсуждать её использование как главной базы флота. 8 сентября 1994 года правительство приняло постановление о формировании Новороссийского района и системе базирования на Кубани, что стало основанием праздника.

Однако ветераны считают правильной датой создание базы — 15 марта 1940 года, когда в приказе НК ВМФ СССР закрепили окончание формирования Новороссийской и Одесской баз. Было решено перенести дату праздника, и 8 августа 2024 года командование ВМФ установило новую дату.

Сегодня НВМБ — современное соединение Черноморского флота, выполняющее задачи по охране границы, снабжению флота и обеспечению перевозок, сотрудничая с Южным военным округом и погранвойсками. В базе служат военнослужащие и гражданский персонал, сохраняющие традиции подводников и бойцов.